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Novartis 標誌
個案研究

合作研發新冠病毒藥物

公司

Novartis Institutes for BioMedical Research(NIBR)

產業

製藥業

獨立軟體供應商 (ISV)

Nanome

Novartis 在 Nanome 與 Oculus 的協助下,正試圖解決當前與未來的全球性流行病問題

瞭解 Novartis 如何透過 Nanome 與 Oculus 提供的解決方案,加速早期藥物研發過程

Novartis Institutes for BioMedical Research(NIBR)是一個由科學家組成的全球性團隊,致力於研發能根除疾病以及緩解症狀的藥物。該團隊目前正在嘗試解決全球規模最大的幾項公衛難題:針對新冠肺炎(COVID-19)及可能造成下一波疫情的變種病毒,尋找能與之對抗藥物。
藥物的研發過程需耗費大量資金與時間,約需十年時間才能上市。NIBR Emeryville 資料科學部門的一級資深專員 Wilian Cortopassi 每天都會利用運算工具,進一步瞭解候選藥物與人體重要蛋白質結構產生的交互作用。
為提高工作效率及協助尋找有效的治療藥物,他的團隊分析了複雜的 3D 分子資訊,並提出了可進行測試的假說。他表示:「要分析這個領域的成果,我們就必須使用能觀察複雜 3D 物件,又能和物件互動的專用工具,而且還要是最先進的。」

運用虛擬實境輔助影像呈現及分析

過去的早期藥物研究人員受限於選項不足,在進行工作或與同事分享假說時,必須將 3D 分子以 2D 方式呈現,但同事中有許多人(例如藥物化學家與生物學家)並不像他們一樣具備檢視複雜分子結構的專業知識。Cortopassi 等研究人員以往會製作 PowerPoint 簡報來呈現分子結構的不同視圖,或是在 2D 電腦螢幕上呈現 3D 的蛋白質。
但到了 2016 年,拉霍亞(La Jolla)Genomics Institute of the Novartis Research Foundation(GNF)的結構生物學主任 Glen Spraggon 戴上了 Oculus 頭戴式裝置,這種情況便開始發生變化。他當時嘗試使用了 Nanome 的測試版 VR 軟體來協助團隊成員進一步瞭解 3D 蛋白質結構,以及藥物在活化或去活化蛋白質目標以緩解病症時產生鍵結的位置。不久後,NIBR 與 Nanome 便展開合作,開始改善 Nanome 的解決方案。
NIBR Cambridge 副總監 Viktor Hornak 表示:「結構生物學的進步,有助於我們分析更大、更複雜的生物分子結構。
這類 3D 結構在平面的 2D 螢幕上很難分析。但在 VR 中,它們就像真實的 3D 物體一樣,很方便觀察。那種沉浸感非常棒,我們甚至可以進入分子結構中,從內部觀察,這用過去的 3D 視覺化技術是不可能做到的。除此之外,進入 VR 環境後,周圍的所有空間都能當作電腦螢幕。我們可以利用這些空間,把研發過程中的各類資料都具象化。我們現在面對的資訊又多又複雜,這個特色對於找出資訊中的固定模式和各種關聯性非常有幫助。」
Glen Spraggon 補充表示,VR 讓 NIBR 能夠從不同科學家口中得到更多想法。當他第一次帶領團隊成員戴上 Oculus 頭戴式裝置並試用 Nanome 的軟體時,使用 VR 協助研發的可行性便獲得證實了。他說道:「當時還有成員抓著蛋白質,把整個分子延展開來往裡面看。我們當下就意識到,要讓被動觀察的人投入互動,VR 絕對是很好的方法。」

NIBR 的 VR 超能力

即時合作

有效運用時間

將不可能的情境化為可能

VR with Nanome and Oculus has the power of improving our communication for this critical decision-making process.”

WILIAN CORTOPASSI
NIBR 資料科學部門一級資深專員
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