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Nimbus 標誌
個案研究

加快藥物發現速度,創造更健康的未來

公司

Nimbus Therapeutics


產業

製藥業


獨立軟體供應商 (ISV)

Nanome

Nimbus Therapeutics 正在使用 Nanome 和 Oculus 的 VR 解決方案來協助設計突破性藥物

Nimbus Therapeutics 如何在 Nanome 和 Oculus 的協助下開發明日的藥物。

Nimbus Therapeutics 專注於早期發現及開發藥物,並以創造能夠改變生活的藥物為目標。公司的化學家們設計出能夠鎖定已知致病蛋白質的小分子化合物。(可將目標想像為具有許多鑰匙孔的鎖,而化合物就是鑰匙,具有潛在開鎖能力以緩解病症或治癒疾病。)接著,Nimbus 生物學家會在細胞中和動物身上測試這些化合物,以判斷在人體上可能產生的效果。
直到最近,像 Nimbus 的Lewis Whitehead 博士等等的計算藥物化學家,才終於找到能夠與團隊中的化學家和生物學家分享分子結構設計的好方法。Whitehead 說道:「我的腦子裡充滿各種 3D 元素,但其他同行不一定會有和我一樣的 3D 思維方式」最近幾年他試圖以不同的方式縮小這個鴻溝,首先是建立一個用於查看和操作 3D 分子模型的網頁式平台,接著是讓他的團隊使用投影機和 3D 眼鏡在大螢幕上觀察結構。
然後,在 2018 年美國化學學會(American Chemical Society)會議上,他遇見了 Nanome 這家先進虛擬實境分子建模解決方案的開發商。Nanome 團隊給了他一套 Oculus VR 頭戴式裝置以向他展示解決方案。他說:「戴上頭戴式裝置後,一切豁然開朗。」
Nanome VR 解決方案從 Whitehead 博士等計算化學家那裡取得結構資料和模擬演算法,然後將它們轉變成 3D 視覺資料在 VR 中呈現。這讓科學家可以和分子結構真實地互動,透過移動及旋轉來觀看使用傳統 2D 軟體和其他模擬器往往容易遺漏的細節。Nanome 技術長 Sam Hessenauer 表示,「我們創造了一個沉浸式環境,讓化學家能夠在該環境中於蛋白質的結合位點之間建立小分子。這就好像是能夠從鎖的內部打造鑰匙一樣。」
NIMBUS 期望透過投資 VR

每年省下數萬元美金

的專案成本,並使藥物上市時程縮短,進一步提高收益
* 資料來源:Nimbus

加強辦公室和遠端協作。

在辦公室因新型冠狀病毒疫情爆發而關閉之前,Whitehead 博士已開始使用 Nanome 與同事分享新的藥物靶點構想。他並未大型公司會議上展示一般的平面 PowerPoint 投影片,而是戴上頭戴式裝置並將 VR 視覺影像分享到同事的電腦螢幕。「透過 Oculus Quest 頭戴式裝置,就不需要連接線,也不需要實體連接到電腦,因此我可以在會議室之間遊走,並與專案團隊一起快速地部署系統。」

節省成本並加快發現關鍵點的速度。

雖然從發現藥物到臨床試驗再到上市,需要花費多年時間和數百萬美元,但 VR 已經開始協助 Nimbus 縮短這些初期時程及節省一些相關成本。最近,在評估 AMPKβ2 酶(被認為是代謝疾病治療靶點的節點)時,Whitehead 和團隊認為,他們確定了在 AMPKβ2 的大分子結構內進行藥物選擇性的最佳策略。但是,當他戴上 Oculus Quest 頭戴式裝置並在 Nanome 中觀察蛋白質移動模擬時,他發現他們的策略需要做些改變,而且另一個合成載體效果會更好。
他說:「能夠在 VR 中檢查這些結構,讓我們有機會提出其他問題、提出其他實驗並測試我們的想法,以推動科學持續發展。」考慮到他的團隊正在努力縮短 12-18 個月的「先導藥物最適化」週期,以盡快找到臨床試驗候選人,Nanome 和 Oculus 代表巨大的優勢。「在 AMPKβ2 的例子中,我們得以提升我們的化合物對靶點產生的效果。這些類型的決定可讓一年省下數萬美元。」

Nimbus 的超能力

化虛幻為現實

節省大量成本

即時合作

Nanome with Oculus increases our ability to communicate and it increases our productivity. For a drug company to be running one of its chemotypes based on an idea we discovered in VR, well, there’s a lot of money being invested there.”

LEWIS WHITEHEAD, PhD
Nimbus Therapeutics 計算化學總監
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