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案例分析

加速药物研发,创造健康未来

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Nimbus Therapeutics


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Nimbus Therapeutics 运用 Nanome 和 Oculus 提供的 VR 解决方案辅助突破性药物设计

Nimbus Therapeutics 如何借助 Nanome 和 Oculus 的先进技术开发新药

Nimbus Therapeutics 专注于早期药物的探索和研发,志在创制能够挽救生命的新药。该公司的制药专家负责设计能够靶向作用于已知致病蛋白的小分子化合物。(可以将靶点想象成有许多钥匙孔的锁头,这些化合物就是可能通过打开锁头来缓解或治愈疾病的钥匙。)之后,Nimbus 的生物专家会在细胞和动物身上测试这些化合物,以确定它们可能对人类造成的影响。
直到此前,对于如何与团队中的制药专家和生物专家分享自己的分子结构设计,Nimbus 公司的 Lewis Whitehead 等计算机制药专家始终没有找到一种行之有效的方法。“我脑子里全都是 3D 模型,”Whitehead 说道,“但我的同事们对这些 3D 模型的想象未必跟我一样。”近些年来,他曾尝试通过多种不同的方法来消除这种差异,他先是建立了一个网络平台,用于查看和操纵 3D 分子模型,之后还曾让团队成员用投影仪和 3D 眼镜在大屏幕上观看分子结构。
后来,在 2018 年的美国化学学会大会上,他接触到了 Nanome,一家可为分子建模提供先进虚拟现实解决方案的开发商。Nanome 团队递给他一部 Oculus VR 头戴设备,为他进行演示。“刚戴上头戴设备,”他说道,“我就有一种豁然开朗的感觉。”
Nanome 的 VR 解决方案能够领会 Whitehead 博士等计算机制药专家脑海中的分子结构数据和模拟算法,并在 VR 中转换成 3D 可视化图像。科学家们可以借此针对分子结构的实体进行互动,通过移动和旋转来查看在传统 2D 软件和其他解决方案中经常被忽视的细节。“我们创造了一种沉浸式环境,可供制药专家们直接在蛋白质的结合位点构建小分子,”Nanome 首席技术官 Sam Hessenauer 说道,“就像是从锁头的内部配钥匙。”
通过投资 VR,NIMBUS 有望节省项目成本

在项目成本上每年节省数万美元,

同时有望通过加快新药上市进程来增加收益
*数据来源:Nimbus

加强办公室与远程办公之间的协作

在新冠疫情导致办公室被迫关闭之前,Whitehead 博士就已经开始通过 Nanome 的技术解决方案与同事们分享有关药物靶点的新想法。他不需要在大规模的公司会议上借助传统的 2D 幻灯片来进行展示,只需通过头戴设备,就能将他的构想转换成 VR 可视化图形,呈现在同事的电脑屏幕上。“采用 Oculus Quest 头戴设备,既不需要数据线,也不用连接电脑,当我走进一间会议室,就能马上与项目团队完成系统部署。”

节约资金,加快重大成果研究进程

每种药物从研发到临床试验再到最终上市都需要花费多年的时间和巨额的资金投入,对于这种情况,Nimbus 已经开始寻求借助 VR 技术来缩短各项流程的周期,并节约相关资金成本。近日,Whitehead 与研究团队在对 AMPKβ2 酶(一种被认为是代谢性疾病治疗靶点的酶)进行评估时,曾一度认为他们为在 AMPKβ2 酶大分子结构内部的用药选择确定了最佳策略。但当他戴上 Oculus Quest 头戴设备,在 Nanome 的虚拟现实中观察蛋白质移动的模拟图像时,他意识到需要改变策略,另一种人工合成的药物载体才是更好的选择。
“通过在 VR 中观察这些结构,我们有机会发现更多问题,提出新的实验方法,并对我们的想法进行测试,进而推动这方面的科学进步,”他说道。他的团队正在努力缩短长达 12 至 18 个月的“先导化合物优化”周期,尽快创制出临床候选药物。对此,Nanome 与 Oculus 将赋予他们一项显著的优势。“在评估 AMPKβ2 酶时,我们最终决定改变策略,结果有效增加了化合物作用于靶点时的活性。这样的决定每年可以为我们节省数万美元。”

VR 助力 Nimbus

让不可能成为可能

节省大量资金

支持实时协作

Nanome with Oculus increases our ability to communicate and it increases our productivity. For a drug company to be running one of its chemotypes based on an idea we discovered in VR, well, there’s a lot of money being invested there.”

LEWIS WHITEHEAD, PhD
Nimbus Therapeutics 计算化学部主任
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