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ÉTUDE DE CAS

Accélérer la découverte de médicaments pour bâtir un avenir plus sain

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ENTREPRISE

Nimbus Therapeutics

SECTEUR D’ACTIVITÉ

Industrie pharmaceutique

ISV

Nanome

Nimbus Therapeutics utilise les solutions VR de Nanome et d’Oculus pour faciliter la conception de médicaments révolutionnaires

Comment Nimbus Therapeutics développe les médicaments de demain avec l’aide de Nanome et d’Oculus.

Nimbus Therapeutics se consacre à la découverte et au développement de médicaments à un stade précoce dans le but de créer des traitements qui changeront la vie des patients. Les chimistes de la société conçoivent des composés à petites molécules qui ciblent des protéines connues pour provoquer certaines maladies (imaginez que les cibles sont des serrures comportant de nombreux trous, et les composés des clés qui peuvent éventuellement ouvrir les serrures pour soulager des douleurs ou guérir des maladies). Les biologistes de Nimbus testent ensuite ces composés sur des cellules et des animaux afin de déterminer leurs effets potentiels sur l’homme.

Jusqu’à récemment, les chimistes en médecine numérique comme le docteur Lewis Whitehead de Nimbus ne disposaient d’aucun moyen approprié pour partager les structures moléculaires qu’ils concevaient avec les chimistes et les biologistes de leur équipe. « Ma tête est remplie d’images 3D, mais mes homologues ne vivent pas nécessairement en 3D comme moi », explique le docteur Whitehead. Ces dernières années, il a essayé de combler ce fossé de différentes manières, tout d’abord en créant une plate-forme web pour visualiser et manipuler des modèles moléculaires en 3D, puis en demandant à son équipe d’utiliser un projecteur et des lunettes 3D pour analyser les structures sur un grand écran.

Puis, à l’occasion de la conférence de 2018 de l’American Chemical Society, il a découvert Nanome, une entreprise qui venait de développer une solution de réalité virtuelle innovante pour la modélisation moléculaire. L’équipe de Nanome lui a prêté un casque Oculus VR pour qu’il puisse le tester. « En mettant ce casque, j’ai eu une révélation », raconte-t-il.

La solution VR de Nanome permet d’ingérer des données structurelles et des algorithmes de simulation provenant de spécialistes de la chimie numérique comme le docteur Whitehead et de les transformer en représentations 3D en VR. Cela permet aux scientifiques d’interagir physiquement avec les structures moléculaires, en les déplaçant et en les faisant tourner pour voir des détails qui échappent souvent aux logiciels 2D traditionnels et à d’autres simulations. « Nous créons un environnement immersif où les chimistes peuvent produire de petites molécules au niveau du site de liaison d’une protéine », explique Sam Hessenauer, directeur de la technologie chez Nanome. « C’est comme être capable de forger une clé à partir d’une serrure. »

EN INVESTISSANT DANS LA VR, NIMBUS ESPÈRE ÉCONOMISER

DES DIZAINES DE MILLIERS DE DOLLARS PAR AN

SUR LES COÛTS DE SES PROJETS ET ÉVENTUELLEMENT AUGMENTER SON CHIFFRE D’AFFAIRES EN COMMERCIALISANT PLUS RAPIDEMENT SES COMPOSÉS

* Source : Nimbus

Renforcer la collaboration au bureau et à distance.

Avant que le COVID-19 n’entraîne la fermeture des bureaux, le docteur Whitehead avait commencé à utiliser Nanome pour partager de nouvelles idées de cibles médicamenteuses avec ses collègues. Au lieu de montrer les habituelles présentations PowerPoint en 2D lors d’une grande réunion d’entreprise, il a enfilé son casque et partagé ses images VR sur les écrans d’ordinateur de ses collègues. « Avec les casques Oculus Quest, vous n’avez pas besoin de câble ni d’être physiquement relié à un ordinateur. Je pouvais donc me déplacer de salle de réunion en salle de réunion et déployer rapidement le système avec une équipe de projet. »

Économiser de l’argent et accélérer les découvertes cruciales.

Alors qu’il faut de nombreuses années et des millions d’euros pour développer un médicament (de la découverte jusqu’aux essais cliniques, puis aux rayons des pharmacies), la VR commence à aider Nimbus à réduire ces délais initiaux et certains des coûts associés. Récemment, alors qu’ils évaluaient l’enzyme AMPKβ2, considérée comme une cible thérapeutique dans les maladies métaboliques, le docteur Whitehead et son équipe pensaient avoir déterminé la meilleure stratégie pour la sélectivité des médicaments au sein de la grande structure macromoléculaire de l’enzyme. Cependant, après avoir mis son casque Oculus Quest et observé une simulation de la protéine se déplaçant chez Nanome, le docteur Whitehead a pris conscience de la nécessité de changer de stratégie et de trouver un autre vecteur synthétique plus prometteur.

« La possibilité d’examiner ces structures dans la VR nous donne l’occasion de nous poser d’autres questions, de proposer d’autres expériences et de tester nos idées pour faire avancer la science », dit-il. L’enjeu pour son équipe est aujourd’hui de raccourcir le cycle d’optimisation des composés prometteurs, s’étalant actuellement sur 12 à 18 mois, afin d’obtenir un candidat clinique le plus rapidement possible. À cet égard, Nanome et Oculus offrent un sérieux avantage. « Dans le cas de l’enzyme AMPKβ2, nous avons pu rendre nos composés plus actifs sur la cible. De telles décisions permettent d’économiser des dizaines de milliers d’euros par an. »

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