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ESTUDIO DE CASO

Acelerar el descubrimiento de fármacos para crear un futuro más saludable

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EMPRESA

Nimbus Therapeutics

SECTOR

Productos farmacéuticos

PROVEEDOR DE SOFTWARE INDEPENDIENTE

Nanome

Nimbus Therapeutics utiliza soluciones de realidad virtual de Nanome y Oculus para diseñar medicamentos innovadores

De qué forma está desarrollando Nimbus Therapeutics los medicamentos del mañana con ayuda de Nanome y Oculus

Nimbus Therapeutics se centra en el descubrimiento y el desarrollo de fármacos en etapas iniciales con el objetivo de crear medicamentos que supongan un cambio en la vida de las personas. Los químicos de la empresa diseñan compuestos de pequeñas moléculas que tienen como diana las proteínas que se sabe que propagan la enfermedad. (Considera que las dianas son candados con muchas bocallaves y que los compuestos son las llaves que pueden abrir los candados para aliviar o curar la enfermedad). Los biólogos de Nimbus prueban estos compuestos en células y animales para determinar los efectos que pueden tener en humanos.

Hasta hace poco, los químicos farmacéuticos computacionales como el doctor Lewis Whitehead de Nimbus no tenían una buena forma de compartir sus diseños de estructura molecular con los químicos y biólogos de sus equipos. “Mi cabeza piensa en 3D”, comenta Whitehead, “pero mis colegas no viven en 3D del mismo modo que lo hago yo”. En los últimos años, ha intentado solucionar ese problema de diferentes formas: primero, creando una plataforma web para ver y manipular modelos moleculares en 3D y, posteriormente, haciendo que su equipo usara un proyector y gafas 3D para ver las estructuras en una pantalla grande.

Más adelante, en la conferencia American Chemical Society que se celebró en 2018, descubrió Nanome: desarrolladores de una solución de realidad virtual innovadora para el modelado molecular. El equipo de Nanome le cedió unas gafas de realidad virtual de Oculus para hacer una demostración. “Cuando me puse las gafas, tuve una revelación”, comenta.

La solución de realidad virtual de Nanome recibe datos estructurales y algoritmos de simulación de químicos computacionales como el doctor Whitehead y los convierte en visualizaciones en 3D en la realidad virtual. De este modo, los científicos pueden interactuar con estructuras moleculares, moverlas y rotarlas para ver detalles que se suelen perder al utilizar software tradicional en 2D y otras simulaciones. “Creamos un entorno envolvente en el que los químicos pueden desarrollar pequeñas moléculas en el contexto del sitio de unión de una proteína”, comenta Sam Hessenauer, director de tecnología de Nanome. “Es como poder diseñar una llave desde dentro de un candado”.

CON SU INVERSIÓN EN REALIDAD VIRTUAL, NIMBUS ESPERA AHORRAR

DECENAS DE MILES DE DÓLARES AL AÑO

EN COSTES DE PROYECTOS Y, EN POTENCIA, AUMENTAR LOS INGRESOS AL CONSEGUIR QUE LOS COMPUESTOS SE COMERCIALICEN CON MAYOR RAPIDEZ

* Fuente: Nimbus

Mejorar la colaboración en la oficina y de forma remota

Antes de que el COVID-19 obligara a cerrar oficinas, el doctor Whitehead había empezado a utilizar Nanome para compartir ideas de nuevas dianas farmacológicas con sus compañeros. En vez de presentar las habituales diapositivas de PowerPoint en 2D en una gran reunión de la empresa, se puso las gafas y compartió lo que veía en la realidad virtual en las pantallas de los ordenadores de sus compañeros. “Con las gafas Oculus Quest, no necesitas cables ni estar conectado físicamente a un ordenador. Por ello, podía pasar de una sala de reunión a otra e implementar rápidamente el sistema con un equipo de proyecto”.

Ahorrar dinero y acelerar los descubrimientos cruciales

Si bien conseguir que un medicamento pase de la fase de descubrimiento a los ensayos clínicos y, posteriormente, a estar a la venta en farmacias cuesta millones de dólares y lleva varios años, la realidad virtual está empezando a ayudar a Nimbus a reducir esos períodos iniciales y algunos de los costes relacionados. Recientemente, mientras evaluaban la enzima AMPKβ2 (un nodo que se considera una diana terapéutica en enfermedades metabólicas), Whitehead y su equipo pensaron que habían determinado la mejor estrategia de selectividad del medicamento en una gran estructura macromolecular de AMPKβ2. Sin embargo, después de ponerse las gafas Oculus Quest y observar la simulación de la proteína moverse en Nanome, se dio cuenta de que era necesario cambiar esa estrategia y que otro vector sintético era más prometedor.

“Poder inspeccionar estas estructuras en la realidad virtual nos permite hacer otras preguntas, proponer más experimentaciones y probar nuestras ideas para que la ciencia avance”, ha comentado. Dado que su equipo está intentando acortar el ciclo de 12-18 meses de “optimización de cabezas de serie” para conseguir un candidato clínico lo más rápido posible, Nanome y Oculus representan una ventaja significativa. “En el ejemplo de AMPKβ2, conseguimos que nuestros compuestos fueran más activos en la diana. Estos tipos de decisiones pueden ahorrar decenas de miles de dólares al año”.

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